В 1935 г. на Северном Кавказе Карачаевским облисполкомом была организована местная заповедная зона. Основателями выступили борцы за сохранность природных ресурсов, члены географического общества. Административно заповедник относится к Западному Кавказу и подчиняется Карачаевскому району. Общая площадь составляет 85 000 га.
Основная задача сотрудников заповедника – изучение уникальных горных массивов и комплексов Кавказа.
Позже участники географического общества решили повысить сохранность природной территории и зимой 1936 г. создать Тебердинский высокогорный заповедник.
Ход преобразованию дало постановление ВЦИК, которое запрещало использовать лес в эксплуатацию, заниматься рыбной ловлей и охотой.
В 1994 г. Тебердинскому заповедному комплексу был присвоен Диплом европейского Совета.
С 1997 г. мировая сеть биосферных резерватов принимает заповедник в свои круги.
В 2009 г. включают в ЮНЕСКО GLOCHAMOST, а территорию вносят в список Всемирного наследия.
